נולד בלודנברג, ליד וינה.
למד מוסיקה ודת במספר ערים באירופה, וקיבל תואר דוקטור במוסיקולוגיה מאוניברסיטת שטרסבורג ב1928. לימד בזארבריקן (1926-1933) ו-ורוצלב (1934-1938) . היגר לארה''ב בשנת 1938.
החל ללמד מוסיקה יהודית וליטורגיה בהיברו יוניון קולג' בשנת 1939, והפך ליו''ר בית הספר למוסיקה מקודשת של היוניון קולג' בניו יורק בשנת 1951.
מלבד מחקרים מוסיקולוגיים כלליים, ורנר חקר רבות את תחום המוסיקה היהודית, בנושאים כדוגמת השוואה בין מוסיקה יהודית ונוצרית, מלחינים יהודיים, ליטורגיה אשכנזית ועוד.
הלחנותיו של ורנר כוללות לרוב יצירות ליטורגיות יהודיות, בנוסף ליצירות למקהלה, שירים, ומוסיקה אינסטרומנטלית.
מקורות:
אנציקלופדיה ג'ודאיקה
האנציקלופידיה התמציתית למוסיקה יהודית (מייסי נולמן)
אוספי אריק ורנר במכון לאו בק
ביביליוגרפיה של כתבי ורנר ניתן למצוא במוזיקה ג'ודאיקה, כרך 10, N1.